如果您半夜发现自己的消防工程师证书丢失了，请按照以下步骤进行补办：
登报声明
首先，您需要在媒体上刊登遗失证明，声明证书已经丢失，并申请补办。
准备补办材料
聘用企业的营业执照等企业资料。
填写《注册消防工程师聘用信息登记表》。
提供《中华人民共和国注册消防工程师职业资格证书》。
有效身份证明。
与现聘用单位签订的劳动合同或聘用文件、聘用证明。
申请登记前三个月的社会保险证明。
如果原工作或聘用单位出具了解聘合同、离职证明等证明材料，也需要一并提供。
提交补办申请
凭借遗失证明的报刊去公安消防注册办公室申请补办。
联系当地消防部门或发证机构，提交丢失证明和身份证复印件，按流程申请补办。
等待审核
消防部门会对您提交的材料进行审核，确认无误后，为您办理新的消防工程师证件。
领取新证书
审核通过后，您需要前往当地消防部门领取新的消防工程师证件。
在整个补办过程中，请确保所有材料的真实性和完整性，并按照规定的流程进行操作。如果有任何疑问，建议及时联系当地消防部门或发证机构获取帮助。