更换备案工程的监理工程师需要遵循以下步骤：
提交申请
总监理工程师或施工单位需要向原备案机构提交书面申请，说明更换监理工程师的原因以及新的总监理工程师的姓名、职称、资格证书号码等相关信息。申请书应由原总监理工程师亲笔签字，并加盖原单位公章。
附材料
申请书应附上新总监理工程师的身份证明、相关工作经历和资格证书等材料的复印件。新总监理工程师的资格证书应该是与所从事工程类型相适应的。提交的资料具体要求以新备案机构要求为准，应仔细核对，确保提交的资料齐全无误。
审核过程
原备案机构应在10个工作日内审核申请材料。如果申请材料不齐全或者不符合新备案机构要求，原备案机构应及时告知业主单位及总监理单位，要求其补充材料或重新申请备案。如果申请材料符合要求，则应在规定时间内出具转换备案证明，并交予新备案机构。
交接工作
新总监理工程师上任后，原备案机构需要与新监理机构进行交接工作，包括项目资料、监理报告等。交接完成后，新备案机构应当及时将证明文件交付业主单位和总监理单位，并且将更换备案情况通报原备案机构。
持续监管
更换后的总监理工程师需要加强对他或她的培训和监管，确保能够胜任工作，并全程参与施工管理和质量监控。
报备备案
新监理机构需要向相关行政部门报备备案，并在规定时间内完成备案手续。报备过程中可能需要提供新任监理工程师的个人资质证明和任职资格证书等材料。
更新监理计划
监理人员应该更新监理计划，并与建设单位协商确定新的监理工作计划，以确保监理工作的顺利进行。
通过以上步骤，可以确保监理工程师的更换过程合法、规范，并且不影响工程的正常进行。建议在更换过程中，各方应密切协作，确保所有手续和交接工作顺利进行。