二级建造师证书主要被以下单位承认：
建设行政主管部门：
根据《建筑法》和《建筑法实施条例》，二级建造师证书由各省、自治区、直辖市的建设行政主管部门（如建设厅、建设局等）颁发。
行业协会：
中国建筑行业协会也参与二级建造师证书的授予工作。
人力资源和社会保障部门：
二级建造师资格证书由当地省人力资源和社会保障厅颁发。
住房和城乡建设部：
作为建筑行业的主管部门，住房和城乡建设部负责建筑行业的管理和监督工作，包括建筑工程的设计、施工、监理等各个环节，并颁发二级建造师执业资格证书。
综上所述，二级建造师证书被建设行政主管部门、行业协会、人力资源和社会保障部门以及住房和城乡建设部承认。具体使用范围可能因地区政策而异，建议参考当地的具体政策。