二级建造师的档案 会存档。具体存档方式如下：
个人保管：
有些二级建造师选择将档案由个人保管，可能存放在家中或其他私人存储空间。这种情况下，可以直接向建造师本人询问档案的位置。
单位存档：
对于在职人员，二级建造师的档案通常由所在单位进行管理。需要将相关的资格证书、注册证书以及继续教育证明等文件提交给单位的人力资源部门或者专门的档案管理部门，由他们整理归档并进行保管。
人才交流中心存档：
如果没有固定工作单位或单位没有档案管理权限，可以选择将二级建造师档案存放在人才交流中心。需要办理存档手续，填写相关表格，并提交资格证书、注册证书及继续教育证明等材料。人才交流中心会提供档案托管服务，并确保档案安全。
档案转移：
如果更换了工作单位，需要办理档案转移手续。这通常包括填写档案转移申请表，由原单位盖章同意，然后由新单位或人才交流中心出具接收函。完成这些步骤后，原单位会将档案转交给新的保管机构。
综上所述，二级建造师的档案无论是放在个人手中、单位还是人才交流中心，都是需要妥善管理和存档的。建议您根据自己的实际情况选择合适的存档方式，并确保档案的安全和完整。