关于二级建造师注销证件是否会被没收的问题，有以下信息可以参考：
一般不回收证书：
注销二级建造师证书后，原证书仍归本人所有，一般不会回收证书。
注销执业资格证书的情况：
如果注销的是执业资格证书，则该证书和执业资格章会被建设主管部门收回，且再次申请注册时将会被视为初始注册。
注销注册证书的情况：
如果注销的是注册证书，则该证书可以重新注册，但在某些地方可能需要达到一定期限后方可重新注册。
具体操作流程：
注销二级建造师需要提交申请，并收回注册证书和执业印章，具体流程可以咨询当地建设行政主管部门。
综上所述， 一般情况下，注销二级建造师的执业资格证书后，证书和执业资格章会被建设主管部门收回，而注册证书在符合一定条件后可以重新注册。建议注销前咨询当地相关部门以获取更详细的信息。