如果二级建造师的注册证书已经过期且未进行注销，可能会面临以下问题：
证书自动失效
根据相关法规，二级建造师注册证书有效期满后，若未进行延续注册，该证书会自动失效。
无法继续执业
注册期限过了后，持证人无法继续使用该证书进行执业活动。
影响重新注册
如果想要在其他省份或公司注册新的建造师资格，必须先注销现有的二级建造师资格，因为每个省份的建筑业管理信息系统是独立的，一个人只能拥有一个有效的建造师资格。
法律风险
如果持证人已经离职，原单位可能仍会使用其资格证书进行招投标等活动，这可能会给持证人带来不必要的法律风险。
资质审查问题
在资质审查时，如果发现持证人有未注销的资格，可能会影响新单位的资质评定。
建议
及时注销：建议持有过期二级建造师证书的个人，在更换工作单位或者不再从事相关行业时，及时主动办理注销手续，以避免上述问题。
咨询相关部门：如果不确定如何办理注销手续，可以咨询所在省级建设行政主管部门或专业律师获取具体指导和帮助。
通过以上信息，可以明确二级建造师过期未注销的后果及建议，以便及时采取措施，确保自身权益不受影响。