需要消防工程师证书的店铺和公司主要包括以下几类：
大型商场：
商场作为人流密集的商业场所，消防安全至关重要，因此需要消防工程师进行安全管理。
超市：
超市同样需要严格的消防安全管理，以确保顾客和员工的安全。
加油站：
加油站属于易燃易爆场所，必须配备专业的消防工程师进行安全管理。
酒店：
酒店作为人员居住和活动的场所，消防安全同样不可忽视，需要消防工程师进行日常的安全管理和应急处理。
医院：
医院作为人员密集场所，对消防安全有极高的要求，需要消防工程师进行专业的安全管理。
化工企业：
化工企业涉及大量的易燃易爆和有毒有害物质，必须配备消防工程师进行严格的安全管理。
石油企业：
石油企业的生产和储存设施需要专业的消防工程师进行安全管理。
制药企业：
制药企业同样涉及易燃易爆和有毒有害物质，需要消防工程师进行严格的安全管理。
公共娱乐场所：
如电影院、KTV等，这些场所人员众多，消防安全管理尤为重要，需要消防工程师进行安全管理。
消防设施维护企业：
这类企业需要消防工程师进行消防设施的设计、施工、运行和维护。
消防检测公司：
这些公司需要消防工程师进行专业的消防检测和评估工作。
建筑设计院和物业公司：
这些单位在建筑设计、施工和物业管理过程中，需要消防工程师参与消防安全的管理。
综上所述，需要消防工程师证书的店铺和公司主要集中在大型商场、超市、加油站、酒店、医院、化工企业、石油企业、制药企业、公共娱乐场所、消防设施维护企业、消防检测公司、建筑设计院和物业公司等。这些单位对消防安全的管理要求严格，必须配备专业的消防工程师以确保安全。