二级建造师证书被中介扣留的情况，通常涉及以下几个方面的处理：
理解情况
首先，需要明确二建证被中介扣留的具体原因。可能的原因包括合同纠纷、费用未结清等。
解决步骤
沟通协商：主动与中介进行沟通，了解对方扣押证书的具体原因，并保持礼貌，避免激化矛盾。
查阅合同：检查与中介签订的合同，确认合同中关于证书扣押的相关条款，以便有针对性地解决问题。
证据收集：收集与纠纷相关的证据，如转账记录、聊天记录等，以便在需要时提供支持。
法律咨询：如果沟通无果，可以寻求专业律师的帮助，了解自己的权益，并根据律师的建议采取相应措施。
维权途径
行政投诉：向当地住建部门或行业协会投诉，寻求行政力量的介入。
法律诉讼：在收集充分证据的前提下，可以向法院提起诉讼，要求中介归还二建证。
其他建议
如果证书还未注册到单位，可以到发证处申报丢失重办，使以往的证书作废。
根据《中华人民共和国劳动合同法》和相关规定，任何单位和个人不得扣押劳动者的证件。
建议
及时沟通：尽早与中介沟通，了解扣押证书的具体原因，并尽量通过协商解决问题。
保留证据：在沟通过程中，务必保留好所有相关证据，以备不时之需。
寻求专业帮助：如果协商无果，及时寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的权益。
行政投诉：可以向当地住建部门或行业协会投诉，寻求行政力量的介入和支持。
希望以上建议能对您有所帮助，顺利解决二级建造师证书被中介扣留的问题。