监理工程师的组织模式主要有以下几种：
直线式
特点：组织机构简单，权力集中，命令统一，职责分明，决策迅速，隶属关系明确。总监理工程师需要通晓各种业务和多种专业技能，成为“全能”式人物。
职能式
特点：加强了项目监理目标控制的职能化分工，可以发挥职能机构的专业管理作用，提高管理效率，减轻总监理工程师负担。但下级人员可能受多头指挥，指令矛盾可能导致混乱。
直线-职能式
特点：既保持了直线制组织实行直线领导、统一指挥、职责分明的优点，又保持了职能制组织目标管理专业化的优点。但职能部门与指挥部门易产生矛盾，信息传递路线长，不利于互通信息。
矩阵式
特点：加强了各职能部门的横向联系，具有较大的机动性和适应性，将上下左右集权与分权实行最优结合，有利于解决复杂问题，有利于监理人员业务能力的培养。但纵横向协调工作量大，处理不当会造成扯皮现象，产生矛盾。
单独组织
特点：监理机构与业主、设计单位、承包商等单位具有独立的法人地位和财务独立性，服从于业务监理的需要，能保持高度的独立性和客观性。同时，还可以更好地保证监理人员的专业技术水平，提高监理服务的质量和水平。
咨询服务
特点：监理工程师以咨询形式提供服务，可能涉及多个项目或专业领域，提供专业的建议和意见。
施工单位内部
特点：监理工程师在施工单位内部工作，可能负责项目的日常监管和质量控制工作。
总承包
特点：监理工程师在总承包模式下工作，可能涉及项目的整体规划和执行，负责协调各个分包单位的工作。
选择哪种组织模式，需根据项目特点、管理需求、资源条件及监理单位自身情况来定。每种模式都有其优缺点，适用于不同的工程背景和监理需求。