如果公司不归还您的二级建造师证，您可以采取以下措施：
沟通协商
首先，尝试与公司负责人进行沟通，了解公司扣留证书的具体原因。
如果是因为工作需要，您可以提出自己的想法和权益，尽量达成双方都能接受的解决方案。
如果是因为误会或信息不对称，澄清事实后，公司通常会归还证书。
法律途径
如果沟通协商无果，您可以向公司所在地的劳动监察大队投诉，请求其介入调查。
向当地的人力资源和社会保障部门反映情况，寻求帮助。
如果公司扣留证书的行为侵犯了您的合法权益，您可以向人民法院提起诉讼，要求公司归还证书并赔偿损失。
其他选项
如果证书是挂靠在原单位的，您可以尝试与原单位协商解决，或者申请证书丢失挂失。
如果公司拒绝配合，您可以向住建厅投诉，责令原单位办理转出，或者直接挂失补办证书。
建议
保持冷静：在与公司沟通或采取法律行动时，保持冷静和理性，避免情绪化。
收集证据：准备好所有相关证据，如报名缴费证明、考试合格证明、劳动合同等，以支持您的诉求。
咨询专业律师：在采取法律行动前，咨询专业律师，了解相关法律法规，获取法律意见，并确保按照律师的建议准备相应的法律文件。
通过以上步骤，您应该能够采取合适的方法来解决公司不归还二级建造师证的问题。