二级建造师的房建市政专业有以下主要区别：
涉及领域
房建：主要涉及住宅、商业、教育、文化等民用建筑的建造工程，包括房屋结构、水电、采暖通风等方面。
市政：主要涉及城市基础设施建设，如道路建设、桥梁建设、给排水工程、污水处理等。
知识体系
房建：需要掌握的技术和知识主要是住宅建筑和公共建筑的相关技术和标准。
市政：需要具备城市规划、道路桥梁、水利、环保等方面的知识技能。
考试科目
房建：主要考房屋建筑工程法律法规、工程技术、项目管理等内容。
市政：主要考市政工程法律法规、工程技术、项目管理等内容。
案例分析题：两者的案例分析题不同，市政工程的难度相对较大。
就业方向
房建：适用于房地产公司、建筑企业、装修公司等机构，从事房屋建筑工程管理、施工、设计等工作。
市政：适用于政府相关部门、市政工程公司、设计院等机构，从事项目管理、施工、监理等工作。
证书适用范围
房建：适用于房屋建筑工程、装饰工程、安装工程等。
市政：适用于市政公用工程、城市道路、桥梁、给排水等工程项目。
考试难度
市政：难度较大，且证书含金量高，就业机会广泛。
房建：相对较容易，就业方向相对较窄。
总结：
房建和市政专业的二级建造师在涉及领域、知识体系、考试科目、就业方向和证书适用范围等方面都有明显的区别。选择哪个专业取决于个人的兴趣和发展需求。如果希望从事房屋建筑和装饰工程方面的工作，房建专业更为合适；如果希望从事城市基础设施建设和管理工作，市政专业则更为适合。