在二级建造师合同中，甲乙双方的权利和义务通常包括以下几个方面：
甲方的权利与义务
免费为乙方办理相关手续：甲方负责为乙方办理续期注册、变更注册、年检等有关手续，并承担相关费用。
使用乙方证书：甲方有权使用乙方的资格证书办理企业资质年检，未经乙方许可不得转注到其他企业，也不得以乙方名义从事违规违法活动。
支付出场费及补助：在招投标过程中，甲方需支付乙方出场费及差旅补助。
承担事故责任：甲方负责工程项目施工中产生的事故责任、法律责任及经济损失。
配合乙方继续教育：甲方需配合乙方完成建造师证书的继续教育和延期注册手续。
乙方的权利与义务
提供必要资料：乙方应向甲方提供开展服务所需的相关资料和条件。
合理使用证书：乙方应合理使用甲方的证书，不得擅自转让、复制或泄露相关资料。
遵守合同条款：乙方需遵守合同约定的工程进度、安全、环保等要求，并保证工程质量符合标准。
安全事故处理：乙方负责工程期间的安全事故处理及相应责任。
接受甲方管理：乙方需接受甲方的管理，按时完成工作任务，保证工作质量。
合同价款及支付方式
合同价款：双方应明确约定合同价款及支付方式，包括预付款、进度款和尾款的支付比例和时间节点。
违约责任
违约金：双方违反合同约定应承担违约责任，支付违约金并赔偿对方损失。
不可抗力：对于不可抗力事件，双方应协商一致，可解除合同或调整工期。
争议解决
友好协商：双方应通过友好协商解决合同履行过程中发生的争议。
其他条款
保密协议：双方应签订保密协议，乙方在任职期间及离职后两年内不得泄露甲方的商业秘密和技术秘密。
社会保险与福利：甲方应按国家规定为乙方缴纳社会保险，乙方享有相关福利待遇。
这些条款构成了二级建造师合同的基本框架，明确了双方的权利和义务，确保工程项目的顺利进行和双方的合法权益得到保障。在签订合同时，双方应仔细阅读并理解每个条款，确保合同内容明确、具体，避免后续纠纷。