二级建造师资格证书通常不会自动注销。注销通常发生在以下几种情况：
1. 持证人死亡或丧失行为能力；
2. 持证人提出注销申请；
3. 持证人注册证书有效期届满未申请延续注册；
4. 持证人受到刑事处罚，且与工程建设相关；
5. 持证人因违法、违规行为被取消二级建造师资格。
如果持证人因个人原因（如离职、退休等）不再从事二级建造师相关工作，也可以选择主动申请注销证书。
需要注意的是，如果建造师注册单位收到注销函件后配合办理，则业务可以办结。如果注册单位有反对意见并提供相关证明材料，则要求建造师补充资料。
此外，某些地区可能提供在线办理强制注销的服务，无需提交书面申请材料。