二级建造师的机电工程与建筑工程专业在多个方面存在区别：
就业方向
机电工程：适宜从事机电一体化产品开发、制造、设备运行维护和管理等工作，也可在教学、科研、生产和行政部门从事与专业相关的技术、管理或教学工作。
建筑工程：就业方向主要包括建筑施工企业技术部门工程管理人员、监理公司监理员、招投标公司的技术人员、建设单位的管理人员等。
考试难度
建筑工程：被认为是二级建造师六个专业中最简单的一个，报考人数最多。
机电工程：相对复杂一些，需要掌握更多的机械、电气、自动化等方面的知识，对学生的综合能力要求较高。
专业侧重
机电工程：主要学习机电工程技术、施工组织设计、工程招标投标与合同管理、安全生产管理等内容，侧重于机电工程领域的专业知识。
建筑工程：主要涉及土木工程、结构设计等方面的知识，相对来说更容易掌握。
工作内容
机电工程：主要负责机电安装工程项目的施工管理，包括电气、给排水、通风与空调、消防等工程。
建筑工程：涉及建筑施工企业技术部门工程管理人员、监理公司监理员、招投标公司的技术人员、建设单位的管理人员等岗位。
考试科目
机电工程：需要考核《建设工程施工管理》、《建设工程法规及相关知识》和《机电工程管理实务》三个科目。
建筑工程：同样需要考核这三个科目。
建议
对于想要从事相关工作的人来说，可以根据自己的兴趣和能力选择适合自己的专业。如果对机械、电气、自动化等方面感兴趣，并且希望从事机电一体化产品的开发和制造、设备的运行维护以及管理工作，那么选择机电工程会更合适。如果对土木工程、结构设计等方面感兴趣，并且希望从事建筑施工、监理、招投标等技术和管理岗位，那么选择建筑工程会更适合。