消防工程师证书是存在有效期的。具体规定如下：
注册有效期：
注册证的每一注册有效期为3年。在注册证的有效期内，注册消防工程师可以执业，并由本人保管和使用。
申请初始注册：
取得一级或二级注册消防工程师资格证书后，需要在1年内提出初始注册申请。如果逾期申请，则需要符合继续教育要求。
延续注册：
注册证有效期届满前3个月内，应申请延续注册，并符合继续教育要求。若逾期未申请初始注册，需要参加继续教育，并在满足继续教育要求后，方可申请初始注册。
成绩有效期：
一级注册消防工程师的考试成绩实行3年为一个周期的滚动管理，需要在连续的3个考试年度内通过所有应试科目的考试，才能取得资格证书。
综上所述，消防工程师证书在取得后需要按照规定进行注册和延续注册，否则证书将失效。建议注册消防工程师在每个注册有效期内都按时参加继续教育，以保持其执业资格的有效性。