如果你已经通过了二级建造师考试的两门科目，你 可以继续报考未通过的科目。以下是具体的报考流程和注意事项：
成绩滚动：
二级建造师考试的成绩是两年滚动有效的。也就是说，如果你在第一年过了一门，第二年过了两门，但只过了一门，那么第三年只需考第一年过的一门和第二年没过的那一门。
报名流程：
第二年继续考剩下的一科时，你需要以老考生的名义报考，成绩才能滚动。在考试报名系统里会有你的信息，其他报名流程和初次报名一样。你需要选择之前没考过的科目进行报考。
考试科目：
二级建造师考试通常包括三个科目：建设工程施工管理、建设工程法规及相关知识、专业工程管理与实务。如果你已经通过了一门公共科目或专业科目，那么你需要在下一次考试时报考剩余的一门公共科目以及另一门专业科目（如果有的话）。
学习计划：
在准备第二年考试时，建议制定详细的学习计划，重点复习未通过的科目，确保能够顺利通过考试。
综上所述，只要你符合报考条件，并且按照上述流程进行报名和复习，你完全可以在第二年继续报考未通过的科目，并最终取得二级建造师证书。