一级消防工程师考试成绩实行滚动管理，对于参加全部三门科目考试的考生，必须在 连续三个考试年度内通过所有科目才能获得资格证书。因此， 消防工程师两年考过三个科目是可以的，但考生需要在连续的三个考试年度内完成所有科目的考试。
具体来说，考生可以根据自身复习情况合理安排科目考试，可以选择每年过一科，3年考完，或者一年过一科或者两科，第二年继续剩下科目，2年考完。只要三年内考完所有科目，即可视为通过考试。
建议考生制定详细的学习计划，合理安排时间，确保在连续三个考试年度内完成所有科目的学习和考试，以便顺利获得一级消防工程师资格证书。