一级建造师证书持有者可以按照 3600元定额扣除个人所得税。具体来说，根据《个人所得税专项附加扣除暂行办法》的规定，纳税人接受技能人员职业资格继续教育、专业技术人员职业资格继续教育的支出，在取得相关证书的当年，可以按照3600元定额扣除。
此外，需要注意的是，这项扣除需要在取得证书的当年进行申报，并且要填写证书批准日期等信息。如果纳税人在年度汇算清缴期间（通常为次年的3月1日至6月30日）未申报享受该项扣除，将无法再补办。
综上所述，一级建造师证书持有者可以通过继续教育专项附加扣除的方式，在取得证书的当年享受3600元的个人所得税抵扣。