二级建造师停职的办理流程通常包括以下几个步骤：
提交申请
向注册单位提出书面停职申请，说明停职原因和时间期限。
申请书需要申请人签名并加盖公司公章。
审核材料
注册单位对提交的材料进行审核，审核通过后将信息录入管理系统。
公示信息
信息录入管理系统后进行公示，若有异议可向相关部门反映。
办理手续
公示无异议后，提供必要证明材料（如身份证、建造师资格证书等）办理停职手续。
完成停职
办理完手续后正式停职，期间不能从事与建造师相关的活动。
恢复工作
如需恢复工作，向注册单位提出书面申请，申请通过后即可恢复工作。
请注意，具体流程可能因地区而异，建议咨询当地建设行政主管部门获取详细信息。此外，如果涉及法律问题或合同条款，应咨询专业法律意见。