如果您遇到二级建造师证书不被发放的情况，您可以按照以下步骤进行操作：
确认考试结果
登录当地人事考试网站或联系建造师注册中心查询考试是否合格。
资格审核
检查是否符合报考时的学历和工作年限要求。
如有问题，联系报名机构咨询或补充材料。
证书遗失或被盗
向发证机关提出补办申请，并提供必要的证明材料。
投诉与申诉
如果满足条件但发证机关拒绝发放，可向主管部门投诉或申诉。
寻求法律帮助，如咨询律师。
耐心等待
发证机关可能因内部流程或系统更新导致延迟，建议保持联系并关注官方公告。
替代方案
在紧急情况下，可能需要寻找其他方式证明资质。
如果证书被原单位扣留，您可以尝试以下方法：
沟通协商
与原单位沟通，了解原因并尝试协商解决。
法律依据
根据《劳动合同法》和《资格证书管理办法》，离职后原单位应归还资格证书。
维权途径
向劳动监察部门投诉。
申请劳动仲裁。
如果仲裁结果不满意，向法院起诉。
证书丢失挂失
如果证书确实丢失，到注册部门申请证书丢失并挂失。
挂靠潜规则
如果证书是挂靠的，遵守行业规则，尝试和平解决。
请根据具体情况选择合适的解决步骤。