当二级机电建造师面临原单位不配合转出的问题时，可以采取以下策略：
协商沟通
首先尝试与原单位进行友好协商，解释转出原因和必要性，争取对方的理解和支持。
利用合同条款
仔细阅读劳动合同及相关协议，查找是否有关于证书转出方面的明确规定，依据合同条款与公司进行理性商谈。
寻求法律援助
如果协商无果，可以寻求专业律师或相关行业协会的帮助，了解个人权益是否受到侵害，并在必要时通过法律途径解决问题。
向建设行政主管部门投诉
如果原单位仍然拒绝配合，可以向当地建设行政主管部门或建委提交申诉书，说明情况并提供相关证明材料，请求协助解决。
仲裁或法律途径
作为最后的手段，可以考虑申请劳动仲裁或提起诉讼，以确定劳动关系并强制变更（注销）注册信息。
在处理此类问题时，建议保持冷静和理性，尽量通过协商和法律途径解决问题，避免不必要的纠纷和损失。