一级消防工程师证书目前由 应急管理部管理。2018年3月13日，国务委员王勇在进行“关于国务院机构改革方案的说明”时阐明，将公安部的消防管理职责和其他部门相关职责整合，组建应急管理部，作为国务院组成部门。改革后，消防队伍不再具备“军､警”的身份，而成为“民”，消防工作也纳入应急管理部。
具体到一级消防工程师的管理和监督，虽然涉及多个部门，但主要由国家应急管理部进行宏观管理和监督，制定相关法律法规、标准和政策。各级消防部门则负责在辖区内的消防工程设计、施工、验收和维护等工作的日常监管。同时，中国消防协会作为行业协会，对一级消防工程师进行自律管理，制定行业规范和职业道德标准。
因此，一级消防工程师证书的管理和监督主要归应急管理部负责，同时各级消防部门和中国消防协会也承担一定的监管职责。