监理工程师在工程计量中通常采用以下几种方法：
均摊法
对清单中某些项目的合同价款，按合同工期平均计量。例如，为监理工程师提供宿舍、保养测量设备、保养气象记录设备、维护工地清洁和整洁等，这些项目每月都有发生，因此可以采用均摊法进行计量支付。
凭据法
按照承包商提供的凭据进行计量支付。例如，建筑工程险保险费、第三方责任险保险费、履约保证金等项目，一般按凭据法进行计量支付。
估价法
按合同文件的规定，根据工程师估算的已完成的工程价值支付。如为工程师提供办公设施和生活设施、为工程师提供用车、为工程师提供测量设备、天气记录设备、通讯设备等项目。这类清单项目往往要购买几种仪器设备，当承包商对于某一项清单项目中规定购买的仪器设备不能一次购进时，则需采用估价法进行计量支付。
断面法
用于计量某些特定的工程项目，例如隧道、桥梁等结构物的断面尺寸和体积。
图纸法
根据设计图纸进行工程计量，适用于工程量清单中的全部项目。
分解计量法
将一个项目根据工序或部位分解成若干子项，对完成的各子项进行计量支付。
强制确定法
根据一定的规则和方法，强制确定某些项目的工程量。
分析计量法
对某些复杂的项目或费用，通过分析的方法进行计量支付。
这些方法的选择应根据具体的合同条款、工程特点以及实际情况进行确定，以确保计量的准确性和公正性。在实际操作中，监理工程师和承包商应严格按照合同约定的计量方法和程序进行计量，以保证工程计量的顺利进行和双方的利益。