二级建造师的六个专业中，哪个最好取决于个人的职业规划、市场需求、考试难度以及个人兴趣。以下是根据不同来源的信息整理出的专业排名，供您参考：
水利水电工程
市场需求较高，多数地区价格高于市政专业。
适合已经拥有二建证书的考生作为增项选择。
机电工程
考试人数较多，市场需求稳定。
北京地区转注后价格较高。
市政公用工程
被认为是二建中最好的专业之一，就业前景好。
市场需求大，尤其是城市规划和基础设施建设。
公路工程
市场需求相对较小，但不同地区价格差异较大。
广东省价格最高，转注后可达较高年薪。
矿业工程
市场需求量非常少，报考人数少。
自学难度大，建议考虑报辅导班。
建筑工程
考试人数最多，但价格不是最高。
适合初学者，考试门槛相对较低。
根据以上信息， 市政公用工程和 水利水电工程通常被认为是较好的选择，但具体哪个更好还需结合个人情况和市场动态来决定。