一级建造师证书被扣留时，可以采取以下措施：
与原单位协商
首先应尝试与原用人单位进行友好协商，看是否能够通过沟通解决问题。如果协商不成，可以采取进一步的法律行动。
法律途径
如果协商无果，可以向劳动仲裁部门或法院申诉，要求解除劳动关系，并出示相关证明材料。持证人需要准备情况说明、身份证原件、解聘证明等材料，提交至省级建设行业行政主管部门办理注销手续。
利用法律武器
根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条，用人单位不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件。因此，原单位扣留建造师证书是违法行为，可以依法索回。若原单位仍然拒绝配合，可以寻求法律帮助，维护自身权益。
注销注册
若原聘用单位不配合出具解聘、离职证明，建议尽快向劳动仲裁部门或法院申诉解除劳动关系，以维护自身权益。在解除劳动关系后，企业仍不予配合办理建造师相关手续的，可提交申请报告和相关证明材料原件和复印件，到省注册中心注册科进行申诉。
线上申报
从2024年10月8日开始，一级建造师等人员可以通过系统线上申报强制注销业务，无需提交书面材料。这一措施简化了注销流程，使得处理此类问题更加便捷。
重新申报
如果建造师证书还没有注册到单位，可以到发证处申报丢失重办，这样以往的证书便可作废。
在处理这类问题时，建议保持冷静，通过合法途径维护自己的权益。同时，要注意收集和保留所有相关的证据和文件，以便在需要时能够迅速有效地解决问题。