如果二级建造师被查出存在问题，可能会面临以下几种处理方式：
行政处罚
根据《建筑法》等相关法规，二级建造师可能会被处以警告、罚款、吊销执业资格证书等行政处罚。具体处罚的种类和程度将依据违法行为的性质和严重程度来确定。
行业禁入
对于严重违反职业道德或法律规定的行为，二级建造师可能会受到一定期限的行业禁入处罚，即在规定期限内不得从事与建筑行业相关的任何工作。
刑事责任
如果二级建造师的违法行为构成犯罪，如重大工程质量安全事故等，除了上述行政处罚外，还可能被追究刑事责任，包括有期徒刑、拘役或者罚金等刑罚。
赔偿损失
如果二级建造师的违法行为给第三方造成了损失，根据相关法律规定，可能需要承担赔偿责任，包括但不限于经济损失、修复费用等。
信用记录
在调查和处理过程中，二级建造师的不良行为会被记入个人信用记录，这可能会影响其未来的职业发展和资格认证。
教育和培训
为了纠正不良行为和提高专业素质，二级建造师可能需要进行一定的教育和培训，以重新获得从业资格。
行政复议或诉讼
如果二级建造师对处理结果有异议，可以在规定的期限内申请行政复议或者提起行政诉讼，寻求法律途径的保护。
面对被查处的处理，建议采取以下措施：
保持积极配合的态度，及时改正错误，并承担相应的法律责任。
通过合法途径维护自己的权益，例如申请行政复议或提起行政诉讼。
了解并遵守相关法律法规，避免再次出现违规行为。
以上建议仅供参考，具体情况还需根据当地法律法规和具体情况进行判断和处理。