二级建造师的注册周期确实发生了变更， 由三年变为五年。具体依据如下：
1. 2022年2月21日，住房城乡建设部办公厅发布的《关于征求注册建造师管理规定（征求意见稿）意见的函》中明确提到，二级建造师即将全国通用，且注册周期将由三年变为五年。
2. 2022年1月20日，同样的文件再次确认了这一变更，指出二级建造师证书的有效期将变为5年。
3. 2020年2月22日的文件也提到了这一变更，并解释了变更的原因，包括减少注册流程、对应企业资质的有效期，以及减少建造师挂靠的频繁操作。
因此，可以确定二级建造师的注册周期已经由三年变更为五年。这一变更旨在简化注册流程，减少不必要的行政负担，并与企业资质的有效期保持一致。