二级建造师不能考取的证书主要包括：
1. 与建筑工程专业无关的专业证书，如金融、法律、医学等。
2. 建筑工程专业以外的其他工程专业证书，如机械工程、电子工程、计算机工程等。
3. 需要更高专业技术能力和综合素质的职称证书，如注册建筑师、结构师等。
4. 一些基层职位的资质证书，如施工员、质量员等，在没有相应工作经验和资质的情况下也不能考取。
需要注意的是，二级建造师需要考取的证书包括安全生产考核证书、环境影响评价初级资格证书、建筑企业职业健康安全管理体系（GB/T 28001）认证、建筑施工企业信用评价证书等。