一级建造师考试的成绩实行2年为一个周期的滚动管理办法。如果您在连续的两个年度内只通过了三科，那么情况如下：
1. 同一专业的科目，如果只通过了一科，那么这一科的成绩在第二年将不再有效，需要重新考试。
2. 不同专业的科目，如果只通过了一科，这一科的成绩在第二年仍然有效，但只能在同一单位使用。
3. 要取得一级建造师资格证书，您需要在第三年考过所有未通过的科目。
因此，如果您在两年内通过了三科，那么您需要在第三年考过所有未通过的科目才能获得证书。需要注意的是，一级建造师考试科目包括《建设工程经济》、《建设工程法规及相关知识》、《建设工程项目管理》和《专业工程管理与实务》。