一级建造师考试通常要求考生在连续两年内通过全部四个科目才能获得资格证书。如果考生在连续的两个年度内只通过了三个科目，那么情况如下：
1. 如果考生在同一专业内只通过了三个科目，那么这些成绩会被注销，无法获得证书。
2. 如果考生在不同的专业内通过了三个科目，这些成绩仍然有效，但考生只能在同一单位使用这些成绩。
3. 考生必须在下一年度的考试中通过剩下的一个科目，才能获得资格证书。如果未能通过，则之前通过的三科成绩也会作废。
因此，如果一级建造师只考过了三科，考生需要准备并在下一年度内通过剩下的科目，才能最终获得一级建造师的资格证书。需要注意的是，一级建造师考试的成绩保留期限为五年，考生必须在五年内完成考试并申请注册证书。