注册中级安全工程师缺考的后果主要包括以下几点：
成绩查询显示：
缺考的科目在成绩查询时会显示为“-1”，这表明考生虽然报名了考试，但实际上并未参加考试。
成绩影响：
缺考不会影响之前已经通过的其他科目的成绩，但会浪费本次考试机会，且报名费用不予退还。
再次报考：
根据相关规定，注册安全工程师缺考不会影响考生下一次报考的资格，可以继续参加考试。
违纪处理：
如果考生缺考是因为未按规定时间、地点参加考试等违纪行为，则可能会被视为违纪，并受到相应的处理。
心态和信心：
缺考可能会影响考生的心态和信心，尤其是对于难度较高的中级安全工程师考试，缺考可能会让考生失去信心和动力。
综上所述，注册中级安全工程师缺考主要影响在于成绩查询时显示“-1”，浪费了一次考试机会和报名费，但不会影响后续的报考资格。建议考生在报名前充分考虑自己的时间和准备情况，确保能够参加考试，避免不必要的损失。