当二级建造师被扣5分时，您可以按照以下步骤处理：
了解扣分原因
登录当地建设行政主管部门的官方网站或联系发证机关查询具体的扣分原因。
准备申诉材料
准备个人身份证明、建造师资格证书、扣分通知及相关证明材料。
提交申诉申请
将准备好的材料提交给发证机关或建设行政主管部门，并填写申诉申请表。
等待处理结果
保持联系方式畅通，等待相关部门的通知或询问。
根据结果采取相应措施
申诉成功后，扣分可能被撤销或减少，可继续使用建造师资格。
申诉不成功，可能需要参加继续教育培训、重新考试等补救措施。
预防再次扣分
加强法律法规学习，提高专业素养和职业道德水平，遵守行业规定和操作规程。
请确保按照规定的流程和要求进行操作，并保持诚信执业。