关于二级建造师三门科目中过两门的情况，有以下几点说明：
两年周期内通过所有科目
二建考试需要在连续的两个考试年度内通过所有的三门科目考试，才能取得二级建造师资格证书。
第二年需重新报名未考科目
如果你在第一年已经通过了两门科目，那么在第二年需要重新报名并参加未考过的一门科目，只有两门科目都合格后才能取得资格证书。
免考条件
在二级建造师考试中，有两门基础科目（如《建设工程施工管理》和《建设工程法规及相关知识》）如果满足免考条件，可以免考，免考部分科目的考试周期只有一年，即只有考三科的考试周期为2年。
成绩保留与作废
第一年考试通过的两门科目成绩会保留，第二年如果这两门科目都通过了，就可以获取证书。如果第二年有一门没有通过，那么第一年已通过的科目成绩作废，第三年需要重新考除了第二年未通过的科目外的另外两门科目。
综上所述，如果你在第一年已经通过了两门科目，那么在第二年需要重新报名并参加未考过的一门科目，只有两门科目都合格后才能取得二级建造师资格证书。建议你在第二年认真备考，确保能够顺利通过剩余的一门科目。