如果您的二级建造师证书已经注册了三年，您需要按照以下步骤操作：
确认是否需要继续教育
如果您的证书已经超过三年未注册，您需要先确认是否需要进行继续教育。根据最新的规定，如果证书到期后未进行注册，您仍然可以继续注册，而不需要先完成继续教育。但是，如果您的证书即将到期或已经超过三年，建议您参加继续教育以确保顺利注册。
参加继续教育
如果您需要参加继续教育，可以通过当地建设行政主管部门指定的网站了解具体的继续教育课程和要求。继续教育分为必修课和选修课，每个注册有效期内各为60学时。完成继续教育并达到合格标准后，您将获得继续教育合格证书。
准备延续注册材料
如果您决定申请延续注册，需要准备以下材料：
有效的身份证明
二级建造师资格证书
继续教育合格证明（如有）
近期一寸免冠照片若干张
注册期内的工作业绩或项目证明
填写《二级建造师延续注册申请表》，并确保所有信息准确无误。
提交申请
将准备好的材料及填写好的延续注册申请表一并提交至您所在地的建设行政主管部门或其指定的机构。提交的材料需为原件，并附带复印件。
等待审核和缴费
相关部门将对您的申请材料进行审核，确认是否符合延续注册的条件。审核通过后，您需要按照规定缴纳延续注册的手续费。费用标准根据各地政策有所不同。
领取新证书
完成缴费后，等待一段时间，新的二级建造师注册证书将会发放给您。领取时记得带上身份证原件以便核实身份。
通过以上步骤，您可以顺利完成二级建造师证书的延续注册。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请咨询当地的建设行政主管部门或相关机构。