如果您作为二级建造师的B类安全员证书被原建筑公司扣留或不予发放，您可以采取以下措施：
与公司沟通
首先，尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，了解为何不发放证书。可能存在误解或需要提供额外的证明材料来证明您的资格。
寻求帮助
如果内部沟通无果，您可以咨询当地的劳动监察部门或工会，了解您的权利和应采取的措施。
提起诉讼
如果认为自己的权利受到侵犯，您可以考虑提起诉讼。请咨询律师，了解具体的法律途径和可能的法律后果。
投诉至相关部门
如果原单位无正当理由拒绝配合办理有关手续，您可以向劳动保障部门、法律机关或单位的上级主管单位进行投诉。
重新办理证书
如果证书被扣留或遗失，您可以在报刊上发布遗失证明，然后携带有效证件和相关证明材料到住房和城乡建设厅办理遗失手续，并重新申请二级建造师B类安全员证书。
在采取任何措施之前，请确保您有充分的证据和材料支持自己的立场，并保持冷静和理智。如有必要，寻求专业律师的帮助也是明智的选择。