监理工程师在工程监理中的方法主要包括以下几种：
见证：
监理工程师在施工过程中对关键部位或关键工序进行见证，以确保施工符合规定要求。
旁站监督：
监理人员在关键部位或关键工序施工过程中，在现场进行监督，确保施工质量和进度。
巡视：
监理人员对正在施工的部位或工序进行定期或不定期的监督，检查施工质量和进度，及时发现和处理问题。
平行检验：
项目监理机构在承包单位自检的基础上，按照一定的比例独立进行检查或检测，以确保工程质量。
测量：
监理人员利用测量手段，在施工过程中控制工程轴线和标高，检查验收时测量各部位的几何尺寸等。
试验：
监理人员对项目或材料的质量评价，必须通过试验取得数据后进行，不允许仅凭经验、目测或感觉评价质量。
严格执行监理程序：
强化施工单位做好开工前各项准备工作，保证监理工程师的核心地位。
工地例会：
由项目监理机构主持，在工程实施过程中定期召开的会议，讨论工程质量、造价、进度、合同管理等事宜。
审查：
项目监理机构对施工单位报送的技术文件、报审或报验的相关资料进行审查，包括程序性审查和实质性审查，确保其符合法律、法规、规范、规程及技术标准。
问题跟踪：
监理工程师在项目实施过程中，通过获取项目资料和相关资料，熟悉项目建设内容、目标、适用法律、法规、标准规范等，并进行日常思考和对比，发现问题并及时进行纠正。
目标规划：
围绕工程项目投资、进度和质量目标进行研究确定、分解综合、计划安排、制定措施等，作为目标控制的基础和前提。
动态控制：
在项目实施过程中，通过对过程、目标和活动的动态跟踪，全面、及时、准确地掌握工程信息，定期地将实际目标值与计划目标值进行对比，采取措施加以纠正，以保证计划总目标的实现。
组织协调：
连接、联合、调和所有的活动及力量，包括人际关系的协调、管理协调、组织协调等，确保施工各个环节有序到位。
这些方法的应用旨在确保工程按照设计要求、合同规定和相关标准顺利进行，同时保障工程质量和安全，最终实现项目的成功实施。