安全工程师证书的发证机构如下：
中级注册安全工程师职业资格证书：
由各省、自治区、直辖市的人力资源社会保障部门颁发。该证书由人力资源社会保障部统一印制，应急管理部与人力资源社会保障部共同用印，在全国范围内有效。
注册安全工程师执业资格证书：
注册安全工程师执业资格考试合格人员，将获得由各省、自治区、直辖市人事部门颁发的《中华人民共和国注册安全工程师执业资格证书》。该证书由人事部和国家安全生产监督管理局用印。
注册证：
取得注册安全工程师执业资格证书后，需要注册的人员，由本人提出申请，经所在单位同意，报当地省级安全生产监督管理部门初审，初审合格后，统一报国家安全生产监督管理局或其授权的机构办理注册登记手续。准予注册的申请人，由应急管理部核发《中华人民共和国注册安全工程师注册证》。
综上所述，安全工程师证书的发放主要涉及 各省、自治区、直辖市的人力资源社会保障部门以及 国家安全生产监督管理局或其授权的机构。建议您在申请注册安全工程师证书时，明确具体的发证机构，以确保流程的顺利进行。