关于二级建造师哪个行业最好的问题，可以得出以下结论：
市政工程
市政工程专业被认为是二级建造师中最受欢迎和最吃香的专业。它涉及城市地区和镇（乡）的规划建设项目，一般属于国家基础设施建设，包括公共交通设施建设、城市绿化等。由于市场需求大，持证人员的供给相对较少，因此市政二级建造师的证书含金量很高，待遇也较好。
建筑工程
建筑工程专业是二级建造师的基础专业，市场需求量很高。从事方向包括房地产开发、施工管理、技术岗位等。虽然市场需求量大，但证书价格相对平稳。
机电工程
机电工程专业需求较多，技术含量高，待遇好。从事方向包括机电装备设计与开发、运行维护、销售与管理等。由于持证人数相对较少，市场上有较大的空缺，证书含金量也不错。
水利水电工程
水利水电工程专业在部分省市的含金量较高，特别是沪、皖、赣、琼四个省市。市场需求量相对较少，但证书含金量仍然较高。
公路工程
公路工程市场需求量不如市政和建筑，但在某些地区如广东省含金量较高。从事方向包括公路施工与管理等。
矿业工程
矿业工程市场需求量较少，但证书含金量与水利水电工程相当。建议作为增项考更为稳妥。
建议
选择专业：建议结合自己的实际情况和职业规划来选择专业。如果希望从事市政工程建设相关的工作，市政工程是最佳选择。如果希望在建筑行业内发展，建筑工程和机电工程也是不错的选择。
市场需求：了解当地市场需求和政策需求，选择需求量大且前景好的专业，可以提高就业竞争力。
考试难度：市政工程专业考试难度较大，但市场需求大，证书收益也较高。如果追求稳定且难度较低，建筑工程专业也是一个不错的选择。
综上所述， 市政工程是二级建造师中最好的专业，但其他专业如建筑工程和机电工程也有很好的发展前景。建议根据个人情况和职业规划做出选择。