如果二级建造师的工作年限填写错误，应该及时进行更正。具体处理方式如下：
联系报名负责单位
如果报名尚未完成，可以联系当地报名负责单位，说明情况并请求重新修改报名信息。
提供证明材料
如果已经打印了报名表且不能更改，需要提供相关证明材料，如劳动合同、社保缴纳证明等，以核实实际工作年限，并联系报名机构进行更正。
确认报名信息的准确性
在缴费之前，务必再次确认报名信息的准确性，避免因信息错误影响报考进程。
建议
尽早更正：发现工作年限填写错误后，应尽早联系相关部门进行更正，避免因时间紧迫而影响报考资格。
准备充分材料：在更正过程中，准备好所有相关的证明材料，以便顺利核实并更正信息。
仔细核对：在填写报名表时，务必仔细核对各项信息，确保无误后再进行提交。
通过以上步骤，可以确保二级建造师报名信息的准确性，避免因工作年限填写错误而影响报考进程。