办理监理工程师证书的流程如下：
个人领证
凭本人有效身份证原件或成绩单领取。成绩单在查询成绩时可直接打印。
他人（单位）代领
凭代领人及持证人有效身份证原件办理。
邮寄领取
根据各地区人事考试网发布的领证通知，按照相关规定申请证书邮寄，支付邮费后等待证书送上门即可。
初始注册
向单位申请办理注册，提交个人身份信息资料、所学专业、工作经历、工程业绩等有关证明材料、初始注册表、劳动合同等资料。
住建部、交通部、水利部分别负责不同专业的证书注册工作，采用网络在线方式进行。注册成功后，将对准予初始注册的监理工程师人员名单进行公告，接受社会监督。
逾期未申请者，须符合近3年继续教育要求后方可申请初始注册。
在线申报
申请人进入中华人民共和国住房和城乡建设部网站办事大厅栏目，选择人员行政许可事项的监理工程师执业资格注册进行在线申报。通过监理企业、建造业企业、工程招标代理机构资质身份加密锁登录《注册监理工程师注册管理信息系统》，填写、打印《中华人民共和国注册监理工程师初始注册申请表》，并上传生成数据电子文档。
申请人向现聘用企业提交初始注册申请资料，经审核同意后，到北京市建筑业资格注册大厅办理相关申报手续。
北京市建委注册管理部门对所有申请初始注册的材料进行初审，形成初审意见后连同相关资料一并上报建设部。建设部对所有申请初始注册的材料进行审查，形成审查意见后在网上进行公示公告，并完成审批手续，对准予初始注册的人员，由建设部统一核发《中华人民共和国注册监理工程师注册执业证书》及执业印章。
现场领取
办理专业监理工程师证时，考生需出示本人身份证原件、1寸照片3张，并填写好《专业技术人员资格考试合格登记表》，一式三份。若由单位集中办理证书，办证单位需出示单位介绍信，同时需提供考生的身份证复印件。如果委托他人办理证书，委托代理人需出示身份证原件，同时也需提供考生的身份证复印件。
建议：
提前了解所在地区的领证通知，选择合适的领取方式（如邮寄或现场领取）。
准备好所有必要的注册材料，确保材料的真实性和完整性。
若选择在线申报，提前登录相关网站，熟悉申报流程和所需材料，确保一次性通过审核。