监理工程师资格证书遗失补办流程如下：
刊登遗失声明
在省、部级有关报纸上刊登遗失声明，说明原因并宣布作废。这一步是为了确保您的证书安全，防止被他人冒用。
填写申请表
填写《监理工程师岗位证书》补办申请表，并由您所在的监理企业提供证明。然后，将申请表提交给省（总公司）级监理工程师注册主管部门进行核查和备案。
准备必要材料
准备好其他必要的材料，包括登有遗失声明的报纸、监理工程师执业资格证书复印件和身份证复印件等。将这些材料提交给建设部监理工程师注册管理部门。
审查合格
经建设部监理工程师注册管理部门审查合格后，您就可以办理证书补发手续了。一般情况下，证书补发会在两个工作日内完成。
损毁补办
如果您的证书损毁需要补办，除不需要登报声明作废外，其他程序与遗失申请相同。
建议您在补办过程中，确保所有材料的真实性和完整性，以便顺利通过审查并尽快拿到新的证书。