消防工程师证书挂失流程如下：
立即报告
发现证书丢失后，应立即向当地消防部门报告，并尽快准备以下材料：
身份证原件及复印件
证书遗失声明
报警回执（如有）
填写申请表
携带上述材料前往当地消防部门，填写《消防工程师证书挂失申请表》
提交申请
提交申请表和材料，等待消防部门审核。审核通过后，消防部门会在规定时间内为您办理挂失手续
领取挂失证明
挂失成功后，您可以向消防部门申请补办证书。补办证书需要提交以下材料：
身份证原件及复印件
挂失回执
近期免冠彩色照片若干
等待制作与发放
等待消防部门制作并发放新证书
注意事项：
挂失时请携带身份证原件和复印件，以便核对身份信息
在媒体上刊登遗失证明，证明证书已经丢失，并申请补办。然后，凭借遗失证明的报刊去公安消防注册办申请补办
申请补办时，需要准备聘用企业的营业执照等企业资料，填写《注册消防工程师聘用信息登记表》，并提供相关证明文件，如劳动合同、社会保险证明、解聘合同或离职证明等
请确保按照以上流程操作，并及时联系当地消防部门以获取最新指导和帮助。