建造师合格证书的注销流程通常包括以下几个步骤：
确认注销条件
与聘用单位解除聘用合同关系；
注册有效期满且未延续注册；
年龄超过65周岁；
死亡或不具有完全民事行为能力；
其他导致注册失效的情形，如聘用单位破产、被吊销营业执照等；
依法被撤销注册、吊销注册证书或受到刑事处罚等。
准备申请材料
《二级注册建造师注销注册申请表》；
符合注销条件的证明材料原件和复印件；
注册证书原件和执业印章。
网上申请（部分地区适用）
通过相关政务服务网或住建部门指定的系统进行网上申报。
提交纸质材料（若需要）
将准备好的纸质申请材料提交给所属地区的建设行政主管部门或其指定的受理机构。
审核与审批
受理部门对申请材料进行初审，主要审查材料的完整性、真实性以及是否符合注销条件；
初审通过后，材料会被报送至上级建设行政主管部门进行复审；
复审通过后，进行备案注销。
完成注销
建设行政主管部门将注销建造师的注册信息，并收回原建造师注册证书；
通过邮寄或领取方式，将建造师的注销证明寄送给申请人。
注销后，建造师将不能再继续从事与建筑工程相关的工作。需要注意的是，注销流程可能因地区而异，具体操作步骤和要求请以当地建设行政主管部门的规定为准。