选择山东建造师考试科目时，可以考虑以下因素：
个人兴趣和专业背景：
选择与自己专业或兴趣相关的科目，可以提高学习的积极性和效率。
市场需求和证书价值：
不同专业的证书市场需求和价格有所不同。一般来说，建筑工程和市政工程的证书需求较大，价格也相对较高。
考试难度：
不同专业的考试难度也有所不同。建筑工程相对简单，但考试要求越来越深入；市政工程涉及范围广，知识点细碎，难度大；机电工程以纯记忆为主，难度相对较低；水利工程包含专业较少，难度适中。
职业规划：
根据个人的职业规划和发展方向选择适合的专业，有助于更好地准备和通过考试。
综合以上因素，以下是一些建议：
建筑工程管理与实务：适合对建筑技术和管理有浓厚兴趣，且希望从事相关行业的考生。该专业考试相对容易上手，但需要系统学习和掌握大量的技术和管理知识。
市政公用工程管理与实务：适合从事市政工程建设一线的施工与管理岗位，且希望提升自己在市政领域的专业能力。该专业考试难度较大，但证书价值高，应用范围广。
机电工程管理与实务：适合从事机电装备设计与开发、运行维护、销售与管理等方面工作的考生。该专业以纯记忆为主，相对容易通过，且市场需求较大。
水利工程：适合从事水利水电工程技术管理与经营管理、建设项目管理、施工管理、水情信息处理、水资源分析、水库调度、城乡供水等技术和管理工作的考生。该专业难度适中，证书属于小范围，但考核人数较多。
最终选择哪个专业，建议结合个人的实际情况和职业规划，进行全面的评估和选择。