建造师证件费用应该计入 管理费用科目。具体来说，使用别人的建造师证给出的费用和管理费用——其他。企业办理营业证照、资质证照的费用应计入管理费用科目，如果为办理个人资质证照支付的费用也可以计入管理费用科目，但为个人支付的费用不属于与收入相关的支出，汇算清缴时应调整（调增）应纳税所得额。此外，公司应该把建造师挂靠费放在管理费用科目核算。
综上所述，建造师证件费用作为公司的一项管理支出，应当计入管理费用科目中。在实际操作中，可以根据具体情况进一步细分科目，如“管理费用——其他”，以便更准确地反映费用的性质和用途。