消防工程师在处理消防系统故障时，应遵循以下流程：
接到故障通知
消防工程师在接到消防系统故障的通知后，应立即响应，尽快到达现场。
确定故障现象
到达现场后，首先与现场人员沟通，了解故障现象，包括故障发生的时间、地点、表现等。
初步检查
对消防系统进行初步检查，包括电源、设备、线路、传感器等，以确定故障范围。
故障诊断
根据初步检查结果，利用专业知识和经验，对故障进行诊断，找出故障原因。
制定解决措施
根据故障原因，制定相应的解决措施，包括维修、更换设备、调整参数等。
提交维修方案
将故障诊断和解决措施形成书面报告，提交给相关负责人审批。
执行维修
在获得审批通过后，消防工程师按照维修方案进行故障处理。
验收与测试
维修完成后，对消防系统进行测试，确保故障得到解决，系统恢复正常运行。
填写维修记录
将故障处理过程、维修内容、更换部件等信息详细记录，以便日后查阅。
告知现场人员
向现场人员说明故障处理结果，提醒注意事项，确保消防安全。
跟踪与回访
在故障处理一段时间后，对消防系统进行跟踪检查，了解运行情况，确保故障不再发生。
此外，针对一些常见的消防系统故障，如自动喷水灭火系统、防排烟系统、防火卷帘系统等，可以采取以下处理措施：
自动喷水灭火系统：
稳压装置频繁启动：检查各水暖件、喷头和末端泄放装置，找出泄漏点进行处理。
水流指示器不报信号：检查浆片是否损坏或塞死不动，检查永久性磁铁、干簧管等器件。
喷头动作后无水：检查湿式报警装置的蝶阀是否动作，检查湿式装置的其它部件。
喷淋泵不动作：检查控制装置及消防泵启动柜连线是否松动或器件失灵，检查喷淋泵本身机械故障。
防排烟系统：
排烟阀打不开：检查排烟阀控制机械是否失灵，电磁铁是否工作正常，手动操作机构是否卡死。
排烟机不启动：检查机械系统及控制部分各器件系统连线是否松动或机械故障。
防火卷帘系统：
防火卷帘门不能上升下降：检查防火卷帘门的机械部件和控制系统的连线是否正常。
通过以上流程和措施，消防工程师可以有效地处理消防系统故障，确保消防系统的正常运行和消防安全。