二级建造师定金的计算主要依据合同金额，具体规定如下：
定金比例：
定金的数额由当事人约定，但不得超过主合同标的额的20%。
定金上限：
如果定金数额超过合同金额的20%，则超过部分无效，实际生效的定金数额为合同金额的20%。
定金与违约金：
定金条款与违约金条款不能并用，如果收受定金的一方不履行约定的债务，应当双倍返还定金。
示例计算
假设一个二级建造师培训课程的总费用为5000元，那么：
定金最高限额为5000元的20%，即1000元。
如果实际交付的定金为5000元，则只有1000元有效，其余4000元视为预付款或额外费用。
注意事项
定金的具体数额和比例应依据当事人之间的合同约定。
如果定金数额超过合同金额的20%，则超过部分可能不被法律支持。
在实际操作中，建议明确约定定金金额，并在合同中详细列明定金的相关条款，以避免后续纠纷。
希望以上信息对您有所帮助。