消防工程师在挂靠项目中的责任主要包括以下几个方面：
法律责任
根据《中华人民共和国消防法》和《注册消防工程师管理规定》，注册消防工程师不得以个人名义承接消防工程业务，不得出租、出借、转让注册证书或者执业印章。如果挂靠的企业发生了消防安全事故，消防工程师可能会因为资质挂靠行为而被追究法律责任。
在严重的情况下，可能吊销执行资格证书。
质量责任
挂靠的消防工程项目质量无法得到保障，可能导致项目验收不通过，影响个人声誉。
道德责任
作为专业人士，消防工程师有责任保证自己的专业行为符合职业道德。随意挂靠资质可能导致企业资质不符，影响消防安全，从而违背职业道德。
经济风险
挂靠项目可能存在拖欠工资、无法兑现承诺等问题，影响个人收入。
信誉风险
挂靠项目可能导致个人信誉受损，影响今后的职业发展。
建议
谨慎选择挂靠：消防工程师在考虑挂靠证书时，应充分了解相关法律法规和潜在风险，遵守规定，确保自己的职业发展安全。
选择无风险挂靠方式：如果确实需要挂靠，建议只挂靠证书，而不将注册章同时挂靠到用证单位，以减少风险。
加强项目管理：即使挂靠，也应确保在项目中履行自己的职责，确保工程质量和安全。
总之，消防工程师在挂靠项目时需要承担一定的责任，包括法律责任、质量责任、道德责任、经济风险和信誉风险。建议在选择挂靠方式时要谨慎，并严格遵守相关法律法规，以保障自己的权益和职业发展。