消防工程师机构的设置主要涉及以下几个方面：
颁发机构
国家消防部门或其授权的地方消防部门：在中国，消防工程师证书的颁发机构主要是国家消防部门或其授权的地方消防部门。具体来说，可以通过中国消防协会或各省、自治区、直辖市消防部门获取证书。
人力资源社会保障部与公安部：一级注册消防工程师资格证书由人力资源社会保障部、公安部委托省、自治区、直辖市人力资源社会保障行政主管部门颁发，该证书在全国范围有效。
管理机构
公安部消防局：公安部消防局负责消防工程师的资质认定和审核工作，确保考生具备相应的专业能力和职业道德。
各省、自治区、直辖市消防部门：地方消防部门在具体实施过程中，负责组织报名、考试和证书的发放工作。
培训和考试机构
中国消防协会：中国消防协会负责组织消防工程师的培训和考试，并为合格者颁发证书。
培训机构
具备资质的培训机构：消防工程师培训机构需要满足法规要求，具备相应资质，合理规划培训内容和师资，注重实践操作。
综上所述，消防工程师机构的设置涉及多个层面，包括国家层面的颁发机构、地方层面的管理机构、专业培训和考试机构，以及具备资质的培训机构。这些机构的协同工作确保了消防工程师证书的权威性、有效性和考试的严谨性。