监理工程师在建设工程中的清单与结算工作主要包括以下几个方面：
协助清单编制
监理工程师需要协助清单编制单位完善工程量清单，确保清单内容准确无误。这包括对工程变更、项目特征不符、工程量清单缺项及工程量偏差等情况的处理。
台账管理
监理工程师应建立和维护工程施工过程中的台账，记录材料使用、施工进度、质量检查等数据。台账是及时发现和解决施工问题的有效工具，同时也是后期工程验收和结算的重要依据。
进度款与结算款审核
监理工程师需根据合同条款和施工进度，审核承包人提交的进度款支付申请，并签认实际付款金额。在竣工结算阶段，监理工程师要审查承包人提交的竣工决算报告，并进行核实和支付。
工程变更与索赔处理
监理工程师负责审查和处理工程变更，调解建设单位与承包单位的合同争议，处理索赔事宜。这些工作对工程结算的准确性和合理性至关重要。
质量保证金管理
在竣工结算时，监理工程师要按合同约定扣留工程质量保证金，确保在工程竣工后一定期限内，承包人履行质量保修责任。
法律法规遵循
监理工程师在结算管理中应严格遵守《建设工程工程量清单计价规范》、《建筑工程施工发包与承包计价管理办法》以及《中华人民共和国招投标法实施条例》等相关法律法规，确保工程计价与结算的合法性和公正性。
通过以上工作，监理工程师在确保工程质量、进度和资金安全的同时，也有效地维护了建设单位和承包方的合法权益。